对于一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，有两种情况需要注意：

　　1、丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。

　　2、丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。

　　另外，根据国税函[2010]162号文件规定，对于外贸企业丢失已开具增值税专用发票发票联和抵扣联的，在增值税专用发票认证相符后，可凭增值税专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，向主管出口退税的税务机关申报出口退税。国税函[2010]162号文件首次明确在丢失已开具增值税专用发票发票联和抵扣联的情况下，通过认证相符记账联可以作为外贸企业申报并计算出口退税的依据。

　　通过以上内容我们发现，如果只是丢失了增值税专用发票的抵扣联或发票联其中一联的，处理起来就比较简单，但如果抵扣联和发票联同时丢失的，处理起来相对就复杂很多，增值税专用发票毕竟不同于普通发票丢失后可以补开，所以一定要小心保管。